Skiepai vaikams Lietuvoje atliekami pagal oficialų vaikų skiepų kalendorių, kurį sudaro privalomos ir rekomenduojamos vakcinos. Kalendoriuje numatyti skiepai nuo tokių ligų kaip tuberkuliozė, hepatito B, kokliušas, difterija, stabligė, poliomielitas, B tipo Haemophilus influenzae, tymai, kiaulytė (parotitas), raudonukė ir kitos infekcijos, kurios anksčiau sukeldavo sunkias komplikacijas ar net mirtis. Kūdikių skiepai pradedami jau pirmosiomis savaitėmis po gimimo. Vienas pirmųjų – hepatito B skiepas kūdikiui, kuris dažnai atliekamas dar ligoninėje, vos gimus. Skiepai naujagimiui yra labai svarbūs, nes naujagimiai dar neturi susiformavusio imuniteto. Svarbu nepraleisti suplanuotų skiepijimo vizitų, nes laiku paskiepyti vaikai yra geriau apsaugoti nuo infekcijų ir jų komplikacijų.

Be privalomų vakcinų, kalendoriuje numatyta galimybė taikyti ir rekomenduojamus skiepus vaikams. Pavyzdžiui, skiepas nuo erkinio encefalito vaikams ypač svarbus tiems, kurie gyvena arba dažnai lankosi gamtoje. Taip pat gripo skiepai vaikams padeda sumažinti sezoninių susirgimų riziką, apsaugoti ne tik vaiką, bet ir aplinkinius – ypač šeimos narius, priklausančius rizikos grupėms.